Hola! En este caso sería "concentrate on", ya que la preposición forma parte del phrasal verb.
A rasgos generales (fuera de las phrasal verbs como esta), "in" se utiliza para referirse al interior de algo, mientras que "on" serviría para hablar de encima de algo.
Por ejemplo, "the ball is in the box" implicaría que la bola está dentro de la caja, mientras que "the ball is on the box" daría el caso de que la bola se encuentra encima de la caja.
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